Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATRIPQ8WXE1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms