Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C17orf53Q8N3J3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C17orf53Q8N3J3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms