Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh2d5Q8JZW5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh2d5Q8JZW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh2d5Q8JZW5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms