Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPAS3Q8IXF0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPAS3Q8IXF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPAS3Q8IXF0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms