Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsr2Q8C8T8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsr2Q8C8T8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms