Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
6820408C15RikQ8BJX2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
6820408C15RikQ8BJX2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms