Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP27Q6ZUM4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms