Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Foxd1Q61345 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Foxd1Q61345 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Foxd1Q61345 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 330.3 ms