Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mkrn3Q60764 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mkrn3Q60764 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mkrn3Q60764 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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