Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38aQ4FK66 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38aQ4FK66 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38aQ4FK66 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms