Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm906Q3V0M1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm906Q3V0M1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms