Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BB287469Q3UT53 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BB287469Q3UT53 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms