Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy4Q3TYX8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rufy4Q3TYX8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms