Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CiartQ3TQ03 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CiartQ3TQ03 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CiartQ3TQ03 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms