Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pate4Q09098 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pate4Q09098 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms