Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MitfQ08874 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MitfQ08874 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms