Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Epha4Q03137 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms