Protein–RNA interactions for Protein: P63220

RPS21, 40S ribosomal protein S21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS21P63220 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS21P63220 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS21P63220 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS21P63220 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS21P63220 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPS21P63220 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS21P63220 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS21P63220 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPS21P63220 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPS21P63220 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS21P63220 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS21P63220 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS21P63220 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms