Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd1P52734 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd1P52734 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd1P52734 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms