Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp1P52624 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp1P52624 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Upp1P52624 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Upp1P52624 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 701.2 ms