Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psen1P49769 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psen1P49769 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psen1P49769 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms