Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCR3P49682 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCR3P49682 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms