Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TfamP40630 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TfamP40630 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TfamP40630 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TfamP40630 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TfamP40630 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TfamP40630 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TfamP40630 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TfamP40630 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TfamP40630 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TfamP40630 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TfamP40630 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TfamP40630 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TfamP40630 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TfamP40630 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms