Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF4A3P38919 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF4A3P38919 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms