Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb9P28076 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb9P28076 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms