Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf239P24399 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Znf239P24399 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf239P24399 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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