Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx8O88983 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx8O88983 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx8O88983 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx8O88983 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx8O88983 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms