Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRPF40AO75400 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF40AO75400 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF40AO75400 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms