Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf5O35326 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf5O35326 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms