Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac1O09106 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac1O09106 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac1O09106 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms