Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna3O08545 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms