Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700056E22RikF7CNM6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.05■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700056E22RikF7CNM6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700056E22RikF7CNM6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms