Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8444F6XS56 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8444F6XS56 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8444F6XS56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8444F6XS56 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8444F6XS56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8444F6XS56 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8444F6XS56 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8444F6XS56 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8444F6XS56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms