Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apba1B2RUJ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apba1B2RUJ5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apba1B2RUJ5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms