Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brpf1B2RRD7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms