Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01549A6NIU2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01549A6NIU2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms