Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms