Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cry2Q9R194 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms