Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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Gpc1Q9QZF2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Gpc1Q9QZF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Gpc1Q9QZF2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gpc1Q9QZF2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Gpc1Q9QZF2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Gpc1Q9QZF2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Gpc1Q9QZF2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Gpc1Q9QZF2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Gpc1Q9QZF2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gpc1Q9QZF2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms