Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHCHD3Q9NX63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHCHD3Q9NX63 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms