Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 219.13■□□□□ 0.651e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 218.83■□□□□ 0.611e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 518.29■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 217.39■□□□□ 0.371e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 216.55■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.081e-6■□□□□ 9.8
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 327.01■■□□□ 1.911e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.481e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 218.38■□□□□ 0.531e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 317.84■□□□□ 0.451e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 511.56□□□□□ -0.561e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.631e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 37.47□□□□□ -1.213e-11■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.063e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-204ENST00000503453 682 ntTSL 319.01■□□□□ 0.632e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-11■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-202ENST00000394225 664 ntTSL 216.37■□□□□ 0.212e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-11■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-14■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.342e-14■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 512.83□□□□□ -0.362e-14■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.583e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFC1-205ENST00000503997 628 ntTSL 311.4□□□□□ -0.582e-8■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PRPF8-203ENST00000571958 380 ntTSL 311.14□□□□□ -0.633e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.783e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -13e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.043e-7■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.32e-14■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 EIF2S3-203ENST00000457332 215 ntTSL 53.43□□□□□ -1.862e-14■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 58.1□□□□□ -1.113e-11■□□□□ 9.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-20■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 523.94■■□□□ 1.426e-9■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.056e-9■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 314.15□□□□□ -0.146e-9■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 39.17□□□□□ -0.946e-9■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.841e-6■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-12■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-209ENST00000582287 696 ntTSL 1 (best)20.66■□□□□ 0.96e-7■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-207ENST00000581672 793 ntTSL 210.56□□□□□ -0.726e-7■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-7■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.084e-26■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-7■□□□□ 9.6
APOBEC3CQ9NRW3 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 219.35■□□□□ 0.691e-7■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 321.97■■□□□ 1.115e-7■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.875e-7■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.85e-7■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.595e-7■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.415e-7■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 TUBB4B-202ENST00000604929 2035 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.745e-11■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.15e-11■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 29.39□□□□□ -0.919e-9■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 FBL-202ENST00000593503 628 ntTSL 37.03□□□□□ -1.289e-9■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 211.76□□□□□ -0.533e-11■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.884e-15■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL24-202ENST00000464595 668 ntTSL 1 (best)8.66□□□□□ -1.024e-15■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.274e-15■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.672e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.222e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPD-209ENST00000513584 1240 ntTSL 225.91■■□□□ 1.742e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.442e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF9-206ENST00000603963 1043 ntTSL 523.95■■□□□ 1.422e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.642e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 PYCR2-206ENST00000478402 3149 ntTSL 214.53□□□□□ -0.082e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 510.18□□□□□ -0.782e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF9-204ENST00000548792 1446 ntTSL 210.1□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SEC61G-205ENST00000460484 1227 ntTSL 1 (best)9.99□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPD-206ENST00000508119 735 ntTSL 29.69□□□□□ -0.862e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.872e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SEC61G-207ENST00000480303 661 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.922e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-8■□□□□ 9.5
APOBEC3CQ9NRW3 CDV3-202ENST00000420115 3621 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■□□□□ 9.5
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 20.2 ms