Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC40A1Q9NP59 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC40A1Q9NP59 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms