Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hmgn5Q9JL35 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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