Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn19Q9ET38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms