Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r50Q9EP51 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms