Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xab2Q9DCD2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xab2Q9DCD2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms