Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubiad1Q9DC60 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubiad1Q9DC60 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms