Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Swt1Q9DBQ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Swt1Q9DBQ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms