Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Borcs5Q9D920 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs5Q9D920 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms