Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc105Q9D4K7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc105Q9D4K7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc105Q9D4K7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms